La Hermandad de Santa Marta, a través de su Diputación de Caridad, mantiene una colaboración directa con diferentes proyectos de la ciudad. Entre ellos, el centro de mayores de la Alameda de Hércules, el economato social de la Fundación Casco Antiguo, al proyecto «Levántate y Anda» de la Cáritas Parroquial de San Vicente Mártir destinado a las personas sin hogar o la acción social conjunta de las Hermandades del Lunes Santo.

Además de la ayuda en Sevilla, la Hermandad de Santa Marta sufraga un taller de carpintería metálica en Benin denominado «Santísimo Cristo de la Caridad» así como recogen alimentos para «Los niños de la calle» de Benin.